Molekylær destillationer en speciel væske-væske-separationsteknologi, som adskiller sig fra traditionel destillation, som bygger på princippet om kogepunktsforskel-separation. Dette er en proces med destillation og rensning af varmefølsomt materiale eller materiale med højt kogepunkt ved hjælp af forskellen i den frie vej for molekylær bevægelse under højvakuum. Anvendes hovedsageligt inden for kemiske, farmaceutiske, petrokemiske, krydderier, plast og olie og andre industrielle områder.
Materialet overføres fra fødebeholderen til hoveddestillationsinddamperen. Gennem rotation af rotoren og kontinuerlig opvarmning skrabes materialevæsken til en ekstremt tynd, turbulent væskefilm og skubbes nedad i en spiralform. I nedstigningsprocessen begynder det lettere materiale (med lavt kogepunkt) i materialevæsken at fordampe, bevæge sig til den interne kondensator og blive til væske, der strømmer ned til den lette fasemodtagende kolbe. Tungere materialer (såsom klorofyl, salte, sukkerarter, voksagtige osv.) fordamper ikke, men flyder i stedet langs hovedfordamperens indre væg ind i den tunge fasemodtagende kolbe.